İnceleme için alınan örneklerin bozulmaması, özelliğini yitirmemesi için kimyasal sıvı koruyucu içine konulup laboratuvara gönderilir.
Örnekler laboratuvarda kaydedilir, ilk olarak dış görünüm değerlendirilir, ardından mikroskop ile incelenmesi gereken kısımlar ayrılır.
Alınan kısımlar örneklenip, küçük ve ince kesitlerin alınmasına olanak verilen işlemlerden uygulanır.
Hazırlanmış olan kesitler özel bir tür boyayla boyanır.
Boyanan kesitler ışık mikroskobu ile incelenir.
Işık mikroskobu yardımı ile yeterli büyütme sağlanamazsa, elektron mikroskobu ile büyütme sağlanarak hücre ve dokular incelenir.
Patoloji laboratuvarında elde edilen örnekler, tanı konulmasını kolaylaştırmak için özel boyalarla boyanıp, genetik incelemeler yapmak için de kullanılabilir.